Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB2P35606 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB2P35606 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB2P35606 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COPB2P35606 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COPB2P35606 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB2P35606 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms