Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD13P35453 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms