Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SFTPDP35247 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms