Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms