Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJA4P35212 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJA4P35212 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJA4P35212 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJA4P35212 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJA4P35212 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJA4P35212 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJA4P35212 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms