Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP6P35125 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP6P35125 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP6P35125 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP6P35125 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP6P35125 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP6P35125 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP6P35125 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP6P35125 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms