Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms