Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTX2P32243 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
OTX2P32243 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
OTX2P32243 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
OTX2P32243 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
OTX2P32243 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms