Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA13P31271 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms