Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms