Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC27P30260 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC27P30260 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC27P30260 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC27P30260 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC27P30260 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC27P30260 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC27P30260 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC27P30260 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC27P30260 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC27P30260 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms