Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms