Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms