Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PLNP26678 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PLNP26678 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PLNP26678 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PLNP26678 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PLNP26678 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PLNP26678 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PLNP26678 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PLNP26678 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms