Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA2P26232 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms