Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms