Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR1P18146 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR1P18146 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR1P18146 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR1P18146 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms