Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC5P13010 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC5P13010 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms