Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms