Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms