Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms