Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P1P0C7P4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms