Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GP1BAP07359 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms