Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLK3P07288 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms