Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3O95983 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD3O95983 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3O95983 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms