Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX58O95786 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX58O95786 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX58O95786 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms