Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG7O95352 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG7O95352 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms