Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms