Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF10O60809 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF10O60809 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms