Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms