Protein–RNA interactions for Protein: O43423

ANP32C, Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member C, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANP32CO43423 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANP32CO43423 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANP32CO43423 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms