Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAA1O43292 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms