Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms