Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRXO43186 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRXO43186 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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