Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM6AO15550 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms