Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms