Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QQQ9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QQQ9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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J3QQQ9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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J3QQQ9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
J3QQQ9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QQQ9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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