Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms