Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQV1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQV1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQV1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQV1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQV1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQV1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQV1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BQV1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BQV1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BQV1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BQV1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms