Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF2D3W0D1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF2D3W0D1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF2D3W0D1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms