Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCP1A6NGW2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms