Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms