Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms