Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms