Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms