Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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FOXD4Q12950 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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FOXD4Q12950 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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FOXD4Q12950 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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FOXD4Q12950 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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FOXD4Q12950 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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