Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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