Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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