Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD50-201ENST00000504087 8794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.1 ms