Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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ITGB3BPQ13352 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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ITGB3BPQ13352 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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ITGB3BPQ13352 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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ITGB3BPQ13352 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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ITGB3BPQ13352 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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ITGB3BPQ13352 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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ITGB3BPQ13352 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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